Die Bücher der Fachbibliothek sind geordnet nach folgender Systematik in den Regalen aufgestellt.
Der Aufbau der Signatur folgt dem Schema:
33-234 oder ND-1567
Die beiden ersten Ziffern bzw. Buchstaben der fünf- oder sechsstelligen Signatur zeigen die Sachgruppe des Buches an, die zweite Zahlengruppe markiert die Position innerhalb der Sachgruppe.
| 00 | Lexika und Nachschlagwerke, Wörterbücher |
| 01, A01 | Festschriften und Wissenschaftsgeschichte |
| 01-5 | Kongressschriften |
| 02 | Zeitschriften |
| 03-04 | Textausgaben |
| 05-07 | Byzantinische Literatur |
| 08 | Volkssprache |
| 10-11 | Handschriftenkataloge, Textgeschichte, Kodikologie, Papyrologie |
| 14 | Urkundenlehre, Diplomatik |
| 15 | Griechische Sprache |
| 17 | Metrik und Musik |
| 18 | Übersetzungen |
| 19 | Belletristische Literatur mit Byzanzbezug |
| 20-21 | Theologie |
| 23 | Apokryphen |
| 24 | Hagiographie |
| 26 | Liturgik |
| 30-32 | Geschichte |
| 33 | Wirtschaftsgeschichte, Kulturgeschichte |
| 36-37 | Religions- und Kirchengeschichte |
| 38 | Mönchtum |
| 39 | Chronologie, Bibliographie und Genealogie |
| 40-41 | Topographie, Geographie und Ethnographie, Archäologie |
| 50 | Kunstgeschichte |
| 53 | Ikonen |
| 55 | Architektur |
| 56 | Plastik |
| 57 | Malerei |
| 58 | Kleinkunst |
| 59 | Ausstellungen, Museumskataloge |
| 60 | Heraldik, Numismatik und Sigillographie |
| 70 | Epigraphik |
| 80 | Jurisprudenz |
| 85 | Kirchenrecht |
| 90 | Realienkunde |
| 91 | Mathematik und Fachwissenschaften |
| 92 | Medizin |
| 93 | Kriegswissenschaft |
| 93-5 | Hochschulschriften |
| 94-97 | Sonderdrucke |
| 98 | Schulprogramme |
| 99 | Rara |
| C | Caucasica |
| PO | Patrologia Orientalis |
| ACO | Acta Conciliorum Oecumenicorum |
| MANSI | Sacrorum conciliorum nova et amplissima collectio |
| PG | Patrologia Graeca |
| AS | Acta Sanctorum |
| Restle | Schenkung Marcell Restle |
| X | AV-Medien |
| NA | Neogräzistik: Primärliteratur |
| NB | Neogräzistik: Sekundärliteratur |
| ND | Neogräzistik: Geschichte |
| NE | Quellen, Archive, Repertorien |
| NM | Medien, Film, Fernsehen, Musik, Fotografie |
| NL | Neugriechische Sprache, Lehr- und Übungsbücher |
